«Бункер», если речь идет про объекты военного назначения, — это не научный термин, а жаргонное слово без четких границ. В разговорной речи так могут называть самые разные защитные сооружения. В официальных советских/российских документах никаких «бункеров» вы не встретите (точнее, встретите,…